理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター RIKEN Center for Life Science Technologies

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研究・技術

タンパク質機能・構造研究チーム

創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術基盤を構築

チームリーダー
白水 美香子   Ph.D.

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1丁目7番22号 西研究棟 W209
Tel: 045-503-9202

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研究内容

個別化医療を担う薬の開発では、分子標的薬など疾患に関与するタンパク質の立体構造の情報がますます重要になります。当チームは、これまで解析が難しかった膜タンパク質をはじめとする高難度タンパク質の試料調製法や結晶化法の開発を行いつつ、創薬・医療等のライフイノベーションに貢献する構造解析技術の基盤を構築します。特に免疫系の疾患に関わるタンパク質複合体や、がん・白血病に関わるキナーゼを中心に構造解析を行います。立体構造情報は創薬候補インシリコスクリーニングへ供され、さらに候補化合物との複合体の構造決定を行うことで創薬に役立てます。

関連技術ページ

論文

1

Identification of pyrrolo[2,3-d]pyrimidines as potent HCK and FLT3-ITD dual inhibitors.

Koda Y, Kikuzato K, Mikuni J, Tanaka A, Yuki H, Honma T, Tomabechi Y, Kukimoto-Niino M, Shirouzu M, Shirai F, Koyama H.
Bioorg Med Chem Lett., 27(22), 4944-4998 (2017).
2

Crystallization and X-ray analysis of 23 nm virus-like particles from Norovirus Chiba strain.

Hasegawa K, Someya Y, Shigematsu H, Kimura-Someya T, Nuemket N, Kumasaka T.
Acta Crystallogr F Struct Biol Commun., 73(Pt 10), 568-573 (2017).
4

Structural basis for CRMP2-induced axonal microtubule formation.

Niwa S, Nakamura F, Tomabechi Y, Aoki M, Shigematsu H, Matsumoto T, Yamagata A, Fukai S, Hirokawa N, Goshima Y, Shirouzu M, Nitta R
Sci Rep., 7(1), 10681 (2017).
5

Dynamic functional assembly of the Torsin AAA+ ATPase and its modulation by LAP1.

Chase AR, Laudermilch E, Wang J, Shigematsu H, Yokoyama T, Schlieker C.
Mol Biol Cell, 28(21), 2765-2772 (2017).
6

Backbone and side chain assignments of the second RNA-binding domain of Musashi-1 in its free form and in complex with 5-mer RNA.

Iwaoka R, Nagata T, Tsuda K, Imai T, Okano H, Kobayashi N, Katahira M.
Biomol NMR Assign.,, (2017).
7

Structure of the complete elongation complex of RNA polymerase II with basal factors.

Ehara H, Yokoyama T, Shigematsu H, Yokoyama S, Shirouzu M, Sekine SI.
Science., 357(6354), 921-924 (2017).
8

Structural Insight into the Recognition of r(UAG) by Musashi-1 RBD2, and Construction of a Model of Musashi-1 RBD1-2 Bound to the Minimum Target RNA.

Iwaoka R, Nagata T, Tsuda K, Imai T, Okano H, Kobayashi N, Katahira M.
Molecules., 22(7), E1207 (2017).
9

Parallel homodimer structures of the extracellular domains of the voltage-gated sodium channel β4 subunit explain its role in cell-cell adhesion.

Shimizu H, Tosaki A, Ohsawa N, Ishizuka-Katsura Y, Shoji S, Miyazaki H, Oyama F, Terada T, Shirouzu M, Sekine SI, Nukina N, Yokoyama S.
J Biol Chem., 292(32), 13428-13440 (2017).
10

Crystal structural characterization reveals novel oligomeric interactions of human voltage-dependent anion channel 1.

Hosaka T, Okazaki M, Kimura-Someya T, Ishizuka-Katsura Y, Ito K, Yokoyama S, Dodo K, Sodeoka M, Shirouzu M.
Protein Sci., 26(9), 1749-1758 (2017).
11

RsgA couples the maturation state of the 30S ribosomal decoding center to activation of its GTPase pocket.

López-Alonso JP, Kaminishi T, Kikuchi T, Hirata Y, Iturrioz I, Dhimole N, Schedlbauer A, Hase Y, Goto S, Kurita D, Muto A, Zhou S, Naoe C, Mills DJ, Gil-Carton D, Takemoto C, Himeno H, Fucini P, Connell SR.
Nucleic Acids Res, 45(11), 6945-6959 (2017).
12

Activity cliff for 7-substituted pyrrolo-pyrimidine inhibitors of HCK explained in terms of predicted basicity of the amine nitrogen.

Yuki H, Kikuzato K, Koda Y, Mikuni J, Tomabechi Y, Kukimoto-Niino M, Tanaka A, Shirai F, Shirouzu M, Koyama H, Honma T.
Bioorg Med Chem., 25(16), 4259-4264 (2017).
13

A reproducible and scalable procedure for preparing bacterial extracts for cell-free protein synthesis.

Katsura K, Matsuda T, Tomabechi Y, Yonemochi M, Hanada K, Ohsawa N, Sakamoto K, Takemoto C, Shirouzu M.
The Journal of Biochemistry,, (2017).
14

Chemical and structural characterization of a model Post-Termination Complex (PoTC) for the ribosome recycling reaction: Evidence for the release of the mRNA by RRF and EF-G.

Iwakura N, Yokoyama T, Quaglia F, Mitsuoka K, Mio K, Shigematsu H, Shirouzu M, Kaji A, Kaji H.
PLoS One., 12(5), e0177972 (2017).
15

Characterization of lysine acetylation of a phosphoenolpyruvate carboxylase involved in glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum.

Nagano-Shoji M, Hamamoto Y, Mizuno Y, Yamada A, Kikuchi M, Shirouzu M, Umehara T, Yoshida M, Nishiyama M, Kosono S.
Mol Microbiol., 104(4), 677-689 (2017).
16

Targeting Ras-Driven Cancer Cell Survival and Invasion through Selective Inhibition of DOCK1.

Tajiri H, Uruno T, Shirai T, Takaya D, Matsunaga S, Setoyama D, Watanabe M, Kukimoto-Niino M, Oisaki K, Ushijima M, Sanematsu F, Honma T, Terada T, Oki E, Shirasawa S, Maehara Y, Kang D, Côté JF, Yokoyama S, Kanai M, Fukui Y.
Cell Rep., 19(5), 969-980 (2017).
17

Existence of two O-like intermediates in the photocycle of Acetabularia rhodopsin II, a light-driven proton pump from a marine alga.

Tamogami J, Kikukawa T, Nara T, Demura M, Kimura-Someya T, Shirouzu M, Yokoyama S, Miyauchi S, Shimono K, Kamo N.
Biophys Physicobiol., 14, 49-55 (2017).

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