理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター RIKEN Center for Life Science Technologies

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研究・技術

分子ネットワーク制御因子開発ユニット

細胞の働きを変える分子を創る

ユニットリーダー
田上 俊輔   Ph.D.

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町 1-7-22 西研究棟 2F C516号室
Tel: 045-503-9205

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研究内容

当研究室では合成生物学・構造生物学的手法を用いて機能的生体高分子の開発に取り組んでいます。

試験管内でのタンパク質複合体の再構成(①)、ペプチド・RNAの試験管内進化(②)、タンパク質のX線結晶構造解析(③)、立体構造をもとにしたタンパク質や結合因子の改変(④)などの技術を組み合わせることで細胞の動態を制御する分子を作成し、医療や基礎生物学への応用を目指します。さらに、制御分子を目的細胞に送り届ける技術(⑤)についても分子ネットワーク制御イメージングユニットと共同開発を行います。

論文

1

Simple peptides derived from the ribosomal core potentiate RNA polymerase ribozyme function.

Tagami S, Attwater J, Holliger P.
Nat Chem., 9(4), 325-332 (2017).
2

Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor

Tagami S, Sekine S, Minakhin L, Esyunina D, Akasaka R, Shirouzu M, Kulbachinskiy A, Severinov K, Yokoyama S.
Genes Dev, 28(5), 521-531 (2014).
3

Chemical fidelity of an RNA polymerase ribozyme.

Attwater J, Tagami S, Kimoto M, Butler K, Kool E, T, Wengel J, Herdewijn P, Hirao I, Holliger P.
Chem Sci, 4, 2804-2814 (2013).
4

Structural basis of transcription by bacterial and eukaryotic RNA polymerases.

Sekine S, Tagami S, Yokoyama S.
Curr Opin Struct Biol, 22(1), 110-118 (2012).
5

A novel conformation of RNA polymerase sheds light on the mechanism of transcription.

Tagami S, Sekine SI, Yokoyama S.
Transcription, 2(4), 162-167 (2011).
6

Crystal structure of bacterial RNA polymerase bound with a transcription inhibitor protein.

Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, Hino N, Murayama Y, Kamegamori S, Yamamoto M, Sakamoto K, Yokoyama S.
Nature, 468(7326), 978-982 (2010).
7

Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Thermus thermophilus transcription elongation complex bound to Gfh1.

Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, Yamamoto M, Yokoyama S.
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun., 66(Pt1), 63-68 (2010).

メンバー  *:兼務